La Dirección de Educación Primaria tiene bajo su cargo la atención y trámite de la prestación de los servicios educativos en todas sus modalidades. Su labor principal consiste en coordinar y vincularse con autoridades nacionales y estatales para la correcta implementación de los planes y programas de estudio, así como de los apoyos educativos que fortalezcan la equidad y calidad en la atención de la población de 6 a 12 años de edad. Para lograrlo, la Dirección organiza, promueve y evalúa el desempeño del sistema en conjunto con delegados, supervisores y jefes de sector, asegurando que las políticas de evaluación se instrumenten de manera efectiva en todo el Estado.

Apoyando estas funciones, el Departamento de Desarrollo Académico coordina las acciones para elevar la calidad de la gestión escolar, participando en la formación de docentes y directivos, además del uso de nuevas tecnologías. Por su parte, el Departamento de Gestión Institucional da seguimiento a los proyectos nacionales y estatales, impulsa la simplificación administrativa en los centros escolares, mediante vínculos con instituciones de educación superior y organismos de la
sociedad civil.